MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1

Total Repeats: 549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017479	TGG	2	6	1328	1333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839614
2	NC_017479	GGC	2	6	1355	1360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839614
3	NC_017479	CTT	2	6	1366	1371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839614
4	NC_017479	GGT	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839614
5	NC_017479	CG	3	6	1453	1458	0 %	0 %	50 %	50 %	385839614
6	NC_017479	GAA	2	6	1492	1497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839614
7	NC_017479	GTA	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839614
8	NC_017479	CGG	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839614
9	NC_017479	AGTGCC	2	12	1722	1733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385839614
10	NC_017479	GTT	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839614
11	NC_017479	CT	3	6	1848	1853	0 %	50 %	0 %	50 %	385839614
12	NC_017479	AAT	2	6	1994	1999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839614
13	NC_017479	TTA	2	6	3522	3527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
14	NC_017479	TAT	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
15	NC_017479	AAC	2	6	3617	3622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839615
16	NC_017479	AGTA	2	8	3692	3699	50 %	25 %	25 %	0 %	385839615
17	NC_017479	ATT	2	6	3745	3750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
18	NC_017479	TGC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839615
19	NC_017479	ATT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
20	NC_017479	ATG	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839615
21	NC_017479	GCA	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839615
22	NC_017479	ATAA	2	8	3939	3946	75 %	25 %	0 %	0 %	385839615
23	NC_017479	AAC	2	6	3977	3982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839615
24	NC_017479	ACA	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839615
25	NC_017479	AAAT	2	8	4112	4119	75 %	25 %	0 %	0 %	385839615
26	NC_017479	TTA	2	6	4237	4242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
27	NC_017479	CTG	2	6	4273	4278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839615
28	NC_017479	TGG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839615
29	NC_017479	TCA	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839615
30	NC_017479	TGG	2	6	4325	4330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839615
31	NC_017479	GAT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839615
32	NC_017479	TAA	2	6	4343	4348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839615
33	NC_017479	ATT	2	6	4375	4380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
34	NC_017479	TAA	2	6	4381	4386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839615
35	NC_017479	AT	3	6	4418	4423	50 %	50 %	0 %	0 %	385839615
36	NC_017479	AATG	2	8	4505	4512	50 %	25 %	25 %	0 %	385839616
37	NC_017479	A	6	6	4553	4558	100 %	0 %	0 %	0 %	385839616
38	NC_017479	ATTA	2	8	4569	4576	50 %	50 %	0 %	0 %	385839616
39	NC_017479	CT	3	6	4577	4582	0 %	50 %	0 %	50 %	385839616
40	NC_017479	ATT	2	6	4591	4596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839616
41	NC_017479	AAAT	2	8	4612	4619	75 %	25 %	0 %	0 %	385839616
42	NC_017479	AAG	2	6	4678	4683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839616
43	NC_017479	AAG	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839616
44	NC_017479	AAG	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839616
45	NC_017479	ATT	2	6	4813	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839616
46	NC_017479	TAT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839616
47	NC_017479	TGA	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839616
48	NC_017479	AAAT	2	8	4838	4845	75 %	25 %	0 %	0 %	385839616
49	NC_017479	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839616
50	NC_017479	GAAAT	2	10	4926	4935	60 %	20 %	20 %	0 %	385839616
51	NC_017479	ACA	2	6	7597	7602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839617
52	NC_017479	TGAT	2	8	7655	7662	25 %	50 %	25 %	0 %	385839617
53	NC_017479	ACC	2	6	7667	7672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839617
54	NC_017479	ATT	2	6	7759	7764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839617
55	NC_017479	GTT	2	6	7851	7856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839617
56	NC_017479	GAA	2	6	7893	7898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839617
57	NC_017479	AC	3	6	7921	7926	50 %	0 %	0 %	50 %	385839617
58	NC_017479	GTC	2	6	8075	8080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839617
59	NC_017479	ACA	2	6	8129	8134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839617
60	NC_017479	AAC	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839617
61	NC_017479	GAA	3	9	8254	8262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839617
62	NC_017479	AAT	2	6	8263	8268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839617
63	NC_017479	T	6	6	8290	8295	0 %	100 %	0 %	0 %	385839617
64	NC_017479	ATA	2	6	8340	8345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839617
65	NC_017479	ATG	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839617
66	NC_017479	AT	3	6	8353	8358	50 %	50 %	0 %	0 %	385839617
67	NC_017479	AT	3	6	8363	8368	50 %	50 %	0 %	0 %	385839617
68	NC_017479	TATAC	2	10	8369	8378	40 %	40 %	0 %	20 %	385839617
69	NC_017479	CAA	2	6	9578	9583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839618
70	NC_017479	TGA	2	6	9590	9595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839618
71	NC_017479	TTTTAC	2	12	9611	9622	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385839618
72	NC_017479	ATTT	2	8	9640	9647	25 %	75 %	0 %	0 %	385839618
73	NC_017479	AGT	2	6	9665	9670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839618
74	NC_017479	A	7	7	9677	9683	100 %	0 %	0 %	0 %	385839618
75	NC_017479	AAC	2	6	9715	9720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839618
76	NC_017479	CAAAAA	2	12	9733	9744	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385839618
77	NC_017479	TGA	2	6	9941	9946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839618
78	NC_017479	CA	4	8	9986	9993	50 %	0 %	0 %	50 %	385839618
79	NC_017479	TA	3	6	9997	10002	50 %	50 %	0 %	0 %	385839618
80	NC_017479	ATA	2	6	10015	10020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839618
81	NC_017479	TGA	2	6	10127	10132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839618
82	NC_017479	TCT	2	6	10165	10170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839618
83	NC_017479	ACT	2	6	10190	10195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839618
84	NC_017479	CAA	2	6	10218	10223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839618
85	NC_017479	GCG	2	6	10226	10231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839618
86	NC_017479	TAT	2	6	10241	10246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839618
87	NC_017479	A	8	8	10322	10329	100 %	0 %	0 %	0 %	385839618
88	NC_017479	TGA	2	6	10330	10335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839618
89	NC_017479	AAG	2	6	10367	10372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839618
90	NC_017479	CGA	2	6	10373	10378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839618
91	NC_017479	TGG	2	6	10440	10445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839618
92	NC_017479	CAA	2	6	10449	10454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839618
93	NC_017479	GAA	2	6	10485	10490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839618
94	NC_017479	AGCG	2	8	10503	10510	25 %	0 %	50 %	25 %	385839618
95	NC_017479	ATT	2	6	10570	10575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839618
96	NC_017479	CACAAA	2	12	11052	11063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839619
97	NC_017479	TAT	2	6	11065	11070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839619
98	NC_017479	GTGG	2	8	11133	11140	0 %	25 %	75 %	0 %	385839619
99	NC_017479	AT	3	6	11143	11148	50 %	50 %	0 %	0 %	385839619
100	NC_017479	ACT	2	6	11150	11155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839619
101	NC_017479	CAA	2	6	11194	11199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839619
102	NC_017479	GCA	2	6	11207	11212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839619
103	NC_017479	T	6	6	11279	11284	0 %	100 %	0 %	0 %	385839619
104	NC_017479	GCC	2	6	11287	11292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839619
105	NC_017479	TTAA	2	8	11294	11301	50 %	50 %	0 %	0 %	385839619
106	NC_017479	A	6	6	11328	11333	100 %	0 %	0 %	0 %	385839619
107	NC_017479	GAC	2	6	11353	11358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839619
108	NC_017479	ATA	2	6	11388	11393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839619
109	NC_017479	CAA	2	6	11399	11404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839619
110	NC_017479	GAAC	2	8	11512	11519	50 %	0 %	25 %	25 %	385839619
111	NC_017479	ATT	2	6	11529	11534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839619
112	NC_017479	ATGAC	2	10	11544	11553	40 %	20 %	20 %	20 %	385839619
113	NC_017479	CAAA	2	8	11607	11614	75 %	0 %	0 %	25 %	385839619
114	NC_017479	A	7	7	11656	11662	100 %	0 %	0 %	0 %	385839619
115	NC_017479	AAG	2	6	11676	11681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839619
116	NC_017479	AAGG	2	8	12639	12646	50 %	0 %	50 %	0 %	385839620
117	NC_017479	ACT	2	6	12652	12657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839620
118	NC_017479	CG	3	6	12666	12671	0 %	0 %	50 %	50 %	385839620
119	NC_017479	A	6	6	12701	12706	100 %	0 %	0 %	0 %	385839620
120	NC_017479	AAAG	2	8	12755	12762	75 %	0 %	25 %	0 %	385839620
121	NC_017479	AGAA	2	8	12835	12842	75 %	0 %	25 %	0 %	385839620
122	NC_017479	CGCA	2	8	12928	12935	25 %	0 %	25 %	50 %	385839620
123	NC_017479	GCAA	2	8	13021	13028	50 %	0 %	25 %	25 %	385839620
124	NC_017479	TGGT	2	8	13068	13075	0 %	50 %	50 %	0 %	385839620
125	NC_017479	A	6	6	13093	13098	100 %	0 %	0 %	0 %	385839620
126	NC_017479	A	6	6	13112	13117	100 %	0 %	0 %	0 %	385839620
127	NC_017479	A	7	7	13150	13156	100 %	0 %	0 %	0 %	385839620
128	NC_017479	CGGAT	2	10	13162	13171	20 %	20 %	40 %	20 %	385839620
129	NC_017479	A	6	6	13230	13235	100 %	0 %	0 %	0 %	385839620
130	NC_017479	CAA	2	6	13252	13257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839620
131	NC_017479	AC	3	6	13365	13370	50 %	0 %	0 %	50 %	385839620
132	NC_017479	GAT	2	6	13423	13428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839620
133	NC_017479	TTA	2	6	13462	13467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839620
134	NC_017479	CTG	2	6	13504	13509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839620
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392	NC_017479	TGA	2	6	31099	31104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839633
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